Softwares de código aberto para modelagem de imagens na saúde - 3D Slicer

 


3D Slicer é um aplicativo de software de código aberto gratuito para visualização e gerenciamento de imagens médicas. Como uma ferramenta de pesquisa clínica, o 3D Slicer é semelhante a uma estação de trabalho de radiologia que oferece suporte a visualizações versáteis, mas também fornece funcionalidade avançada, como segmentação automatizada e registro para uma variedade de domínios de aplicação. Ao contrário de uma estação de trabalho de radiologia típica, o 3D Slicer é gratuito e não está vinculado a um hardware específico. Como uma plataforma de programação, o 3D Slicer facilita a tradução e avaliação dos novos métodos quantitativos, permitindo que o pesquisador biomédico se concentre na implementação do algoritmo e fornecendo abstrações para as tarefas comuns de comunicação de dados, visualização e desenvolvimento de interface de usuário. Em comparação com outras ferramentas que fornecem aspectos dessa funcionalidade, O 3D Slicer é totalmente de código aberto e pode ser prontamente estendido e redistribuído. Além disso, o 3D Slicer foi projetado para facilitar o desenvolvimento de novas funcionalidades na forma de extensões do 3D Slicer.

O software foi feito por desenvolvedores e pesquisadores da área médica em um projeto apoiado pelo National Institute of Health (NIH), com a colaboração de empresas como a Kitware Inc. e General Electric, e uma comunidade de desenvolvedores .

O 3D Slicer permite gerenciar arquivos DICOM do servidor PACS (Picture Archiving and Communication System) e arquivos não específicos, permitindo visualizar e processar imagens em 2D, 3D e 4D (10 Y, Z e T, tempo, por exemplo Detecção com uma sonda de ultrassom). O software oferece a capacidade de renderizar imagens e para criar modelos para uso com software CAD [15].

Do ponto de vista do software, o slice tem uma estrutura modular, com

módulos (módulos centrais) que fornecem gerenciamento barato de arquivo DICOM (I), renderização (Renderização de Volume) e as funções de transformação de imagem em espaço 3D (Transformações). Alguns dos outros módulos relevantes são:

• Filtragem: contém ferramentas para preparar a imagem para processamento posterior (pré-processamento). Os recursos mais usados ​​incluem operações aritméticas, redução de ruído e correção da distribuição de densidade do

varredura, no entanto, existem dezenas de outros algoritmos que podem ser usados.

• Registro: fornece a capacidade de alinhar duas digitalizações uma com a outra;

útil ao alinhar diferentes exames do mesmo paciente ou orientar

varreduras para padronizar um conjunto de dados.

• Segmentação: Segmentação é a separação da imagem em partes menores

regiões com base em suas características. O 3D Slicer integra métodos de segmentação interativos (com intervenção humana) e automáticos.

• Modelos de superfície permitem a criação e gerenciamento de volumes de superfície a serem exportados para processamento posterior em outro software.

• Terapia Guiada por Imagem: dá a possibilidade de troca de dados reais tempo com periféricos, incluindo dispositivos robóticos, scanners e dispositivos de radioterapia. Este recurso permite que dispositivos periféricos sejam usados ​​em conjunto com as imagens de diagnóstico, e podem ser de interesse para uso como guia virtual para a colocação do implante .

Outros módulos estão presentes, e a coleção é freqüentemente expandida

com módulos elaborados pela comunidade, instituições e empresas. Além disso, cada usuário pode criar um módulo e distribuí-lo como uma fonte ou como um

arquivo binário (um arquivo executável); este caminho pode ser usado para pacotes que contêm código proprietário não livre, mas cujos autores ainda desejam distribuir a funcionalidade para a comunidade .

O software é acompanhado por publicações e uma documentação que descreve a funcionalidade implementada . 


https://www.slicer.org/ 3d slicer

Fedorov A., Beichel R., Kalpathy-Cramer J., Finet J., Fillion-Robin J-C., Pujol S., Bauer C., Jennings D., Fennessy F.M., Sonka M., Buatti J., Aylward S.R., Miller J.V., Pieper S., Kikinis R. 3D Slicer as an Image Computing Platform for the Quantitative Imaging Network. Magnetic Resonance Imaging. 2012 Nov;30(9):1323-41.

Comentários

Postar um comentário

Postagens mais visitadas deste blog

A PRESCRIÇÃO MBT

Imagem
A PRESCRIÇÃO MBT As modificações em relação ao aparelho de Andrews propostas por Bennett e McLaughlin foram: O torque nos incisivos foi aumentado em 10º (7º para 17º) no central superior e 7º (3º para 10º) no lateral superior porque, durante o fechamento de espaços e redução do trespasse horizontal, havia a tendência de se perder o torque nestes dentes. Nos incisivos inferiores, o torque foi alterado de -1º para -6º, pois estes dentes terminavam freqüentemente vestibularizados após a eliminação do apinhamento e nivelamento da curva de Spee. O torque nos molares superiores não foi modificado, porém mudaram a angulação de 5º para 0º, pois não mais estavam posicionando as bandas nos molares com uma certa angulação, ou seja, com sua porção mesial mais baixa que sua porção distal, não sendo necessário este ajuste na angulação incorporada no desenho do braquete. Nos segundos molares inferiores, nos quais os valores normais eram de 35º, esse torque foi reduzido para 10º, pois há uma tendência ...
Leia mais

Anatomia dos lábios:sua importância

Imagem
Anatomia dos lábios Os lábios fazem parte do terço inferior da face  e conhecer essa topografia é importante para o planejamento dos trabalhos em Odontologia. Nas reabilitações , planejamentos estéticos , Ortodontia e mais recentemente no uso de preenchedores cada trabalho terá efeito no volume do lábio , espessura , disfarçar volume, expor ou não mais dente, etc. Dentre os objetivos da reabilitação estética estar "expor dentes", grandes, bonitos e fazer terá consequências nos tecidos periorais, pois mexer em inclinação dental, no seu comprimento e espessura tem efeito de projetar lábios , levantar e até rejuvenescer. A partir disso conhecer a anatomia labial e topografia do terço inferior da face  é imprescindível para qual qualquer planejamento ( em post futuro podemos falar sobre relação entre lábios e planejamento. Neste  vamos nos ater a anatomia) Um exemplo seria da interferência da anatomia seria o comprimento do lábio nessa avaliação->...
Leia mais

Bionator de Balters

Imagem
A função do bionator no tratamento ortopédico é obter o espaço bucal ideal e corrigir a posição e a função da língua, lábios e bochechas mediante o estímulo de forças fisiológicas. Desta maneira torna-se possível levar ao pleno desenvolvimento as forças de crescimento próprias do organismo. Tipos de bionatores Existem três tipos de bionatores que se destinam à correção das diferentes anomalias esqueléticas e alterações funcionais: o bionator base,o invertido e o fechado. Algumas disfunções podem exigir escudos de proteção no setor lateral e/ou frontal dos dentes. 1- BIONATOR BASE: utilizado para o tratamento do retrognatismo mandibular. 2 - BIONATOR FECHADO: para a correção das mordidas abertas com ou sem alterações esqueléticas. 3 - BIONATOR INVERTIDO: para corrigir o prognatismo mandibular. Os elementos do bionator não são ativos e nem podem ser ativados. As alterações morfológicas são consequência da normalização funcional. O Bionator é um aparelho bimaxilar de volume reduzido, pode...
Leia mais